制药废水中含有大量COD、SS、盐等高色度物质和有毒物质，由于其水污染物复杂，生化处理很难达标，因此，对制药废水进行PFS混凝预处理后再进行生化处理是十分必要的。
制药废水预处理
    采用厌氧生化系统前的制药废水预处理系统，对废水中残留的药物分子和抗生素活性进行破坏和降解，使难降解物质转化为易降解物质，减少或消除其毒性抑制微生物系统，提高后期生化系统的处理效果。
    制药废水预处理包括设置酸碱调节调节池，酸性废水一般采用投加片状碱、复合碱和石灰的方法进行调节，碱性废水采用投加硫酸等方法进行调节，根据后续需求，进行适当调整，其次，通过格栅、筛网、混凝沉淀、还原氧化等物理化学方法，可大大降低水中的悬浮物、盐度和含盐量；不可聚合硫酸铁可处理制药废水的可溶性COD，将抑制和杀灭微生物的物质还原到水中生化池，影响微生物的生长及其生化处理率，提高后续废水的可生化性。
聚合硫酸铁处理制药废水的工艺效果
    聚合硫酸铁在抗生素废水预处理中的作用：胶体等具有吸附和交联功能的络合离子能中和、吸附和凝聚水中的COD，形成多核络合物等沉积物，随着污泥与水的分离，另外，在预处理-厌氧-好氧后处理过程中，PFS更多地用于后处理。
    从成本考虑，大部分制药废水采用絮凝沉淀水解酸化SBR工艺处理，在制药废水处理中，选用PFS作为混凝剂，主要是因为它具有其它混凝剂的作用，PFS对水的pH值影响不大，产生的污泥较少。